クランの城に大勢いるはずのユニットが1つ残らず消えてしまった場合は、戦闘ログを開いてユニットが攻撃または防衛に使われた記録がないか調べてみてください。また、誤って削除した可能性はないかご確認ください。
数体だけユニットが消えている場合や、城のユニットが不足しているにもかかわらずすでに援軍の寄付を受け付けていない場合、自分の城のユニット収容数を超える援軍を送られた可能性があります。あなたの城に入りきれなかった援軍ユニットは順番待ちの状態になっているので、現在いるユニットを使いきってしまえば城に入ってきます。