對於您的基地來說，能量水晶是一種珍貴的、擁有神秘魔力的財產。
其屬性可以分為以下四種：
* 生命水晶（綠色）
* 寒冰水晶（藍色）
* 熔岩水晶（紅色）
* 暗黑水晶（紫色）
三種不同類型的水晶可分別建造出不同類型的神像：
* 水晶顆粒用於建造小巧神像
* 水晶碎片用於建造精良神像
* 整塊水晶用於建造極品神像
水晶顆粒是最常見的水晶類型，因此建造出的小巧神像能力不大。 水晶碎片的獲得難度較大，所以精良神像加成比例比小巧神像要高。整塊水晶是最稀有的，所以極品神像是加成能力最高的神像。
這些水晶可以在以下地方找到：
* 當您進攻地圖上的群島時–大多數情況您可以在島嶼上的司令部中找到它，有時候會是在其他的建築裡，但不常見。寒冰水晶主要存在於北方的冰雪島嶼上而熔岩水晶則存在於南方島嶼。暗黑水晶則主要存在於恐怖博士的基地上。
* 當您的獎牌數達到了25個，您將可能從每日獎勵中獲得能量水晶。
* 補給箱獲得（每日得到5個獎牌啟動）。
* 經過潛水艇發掘深海寶藏獲得（司令部需要達到9級）。
*通過商人寶箱隨機獲得，或以資源互換的形式，購買商人所提供的商品獲得
想要提高獲取能量水晶的幾率，您需要使用暗黑水晶建造能夠提高“水晶掉落機會”的神像。