舰队目标是强大的对手，只能通过舰队进行攻击，它们很难被常规攻击击败。它们可以在联邦、克林贡、罗慕伦和中立空间的一些星系中找到。联盟每次只能对指定的舰队目标进行一次舰队攻击，但可以同时对多个不同的敌对者目标进行舰队攻击。属于联邦、克林贡或罗慕伦阵营的舰队敌对者在该阵营中具有研究、长官和舰船能力。击败它们将获得阵营点数奖励，但与一般敌对者有所不同，不会扣减任何阵营点数。
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Star Trek™ Fleet Command GAME GUIDE